B 分析:生物進化的證據有化石證據、比較解剖學上的證據、胚胎學上的證據等,化石是指保存在巖層中的古生物遺物和生活遺跡;比較解剖學是對各類脊椎動物的器官和系統進行解剖和比較研究的科學,比較解剖學為生物進化論提供的最重要的證據是同源器官;胚胎學是研究動植物的胚胎形成和發育過程的科學,也為生物進化論提供了很重要的證據,如脊椎動物和人的胚胎早期都有鰓裂和尾,說明了脊椎動物和人是從某些古代的低等動物進化來的. 解答:在研究生物進化的過程中,化石是最重要的、比較全面的證據,化石在地層中出現的先后順序,說明了生物是由簡單到復雜、由低等到高等、由水生到陸生逐漸進化而來的,始祖鳥化石說明了鳥類是由古代的爬行動物進化來的等;生物進化最直接、最主要的證據是化石. 故選B. 點評:理解化石的形成和分布規律是解答的關鍵.